Blog.BlogActualites History

Hide minor edits - Show changes to markup - Cancel

October 26, 2008, at 09:17 PM by SB -
Changed line 5 from:

to:
Changed lines 7-8 from:

Pour plus de détails

to:

Pour plus de détails


October 26, 2008, at 09:14 PM by SB -
Changed line 4 from:

Quelques rapports sur la biologie synthétique

to:

Préparation d'un cycle de débat en France

Added lines 6-8:

Par l'association Vivagora Pour plus de détails

September 08, 2008, at 02:23 PM by SB -
Changed lines 15-16 from:

Cette nouvelle structure chimique est une étape vers des développement de biologie synthétique "orthogonaux" aux systèmes génétiques naturels.

to:

Cette nouvelle structure chimique est une étape vers des développement de biologie synthétique incompatibles avec les systèmes génétiques naturels. Cependant comme ces nouvelles molécules génétiques ont une stabilité plus grande que l'ADN naturel, les auteurs pensent d'avantage à des applications de stockage d'information que dans des applications "viivantes".

They hope to one day use their discovery to create a new biological information storage system that functions outside of the cell. Artificial DNA could be advantageously used instead of natural DNA due to its stability against naturally occurring enzymes and its structural diversity.

Changed lines 23-24 from:

Doi et al. Artificial DNA Made Exclusively of Nonnatural C-Nucleosides with Four Types of Nonnatural Bases. Journal of the American Chemical Society, 2008

to:

L'article original Doi et al. Artificial DNA Made Exclusively of Nonnatural C-Nucleosides with Four Types of Nonnatural Bases. Journal of the American Chemical Society, 2008

Une présentation de ces travaux.

September 08, 2008, at 02:13 PM by SB -
Changed lines 17-19 from:
to:
Added line 22:

September 08, 2008, at 02:11 PM by SB -
Changed lines 13-14 from:
 e groupe de Masahiko Inouye  à l'Université de Toyama est parvenu à inclure dans le squelette de sucre normal de l'ADN quatre bases artificielles en place des naturelles, créant une structure stable double brin ressemblant à l'ADN naturel, sans en être !
to:

Le groupe de Masahiko Inouye à l'Université de Toyama est parvenu à inclure dans le squelette de sucre normal de l'ADN quatre bases artificielles en place des naturelles, créant une structure stable double brin ressemblant à l'ADN naturel, sans en être !

Added line 16:
September 08, 2008, at 02:10 PM by SB -
Changed lines 8-9 from:
to:
Changed lines 13-14 from:
 Le groupe de Masahiko Inouye  à l'Université de Toyama est parvenu à inclure dans le squelette de sucre normal de l'ADN quatre bases artificielles en place des naturelles, créant une structure stable double brin ressemblant à l'ADN naturel, sans en être !
to:
 e groupe de Masahiko Inouye  à l'Université de Toyama est parvenu à inclure dans le squelette de sucre normal de l'ADN quatre bases artificielles en place des naturelles, créant une structure stable double brin ressemblant à l'ADN naturel, sans en être !
Changed lines 16-17 from:
to:
September 08, 2008, at 02:08 PM by SB -
Deleted lines 4-12:
  • Royal Society - Synthetic biology scientific discussion meeting summary

lien vers le rapport

  • International Risk Governance Council - Synthetic Biology - Risks and opportunities of an emerging field

lien vers le rapport

Changed lines 17-19 from:

<http://english.peopledaily.com.cn/90001/90781/6444378.html>

to:
Added lines 21-30:
  • Royal Society - Synthetic biology scientific discussion meeting summary

lien vers le rapport

  • International Risk Governance Council - Synthetic Biology - Risks and opportunities of an emerging field

lien vers le rapport

September 08, 2008, at 02:07 PM by SB -
Added lines 14-29:

Annonce de la synthèse chimique d'une molécule d'<ADN> entièrement artificielle

Attach:artificialDNA.jpg Δ

Des chimiste japonais ont anoncé avoir créé la première molécule d'ADN consitutée presque totalement de composants artificiels. L'ADN est normalement consituté de quatre nucléotides natuelles ("bases") portées par une structure de molécules de sucre, qui sont les briques de construction dont la séquence code pour l'information génétique. Plusieurs chercheurs ont déjà été capables de fabriquer des molécules d'ADN qui incorporent certaines nucléotides non naturelles.

 Le groupe de Masahiko Inouye  à l'Université de Toyama est parvenu à inclure dans le squelette de sucre normal de l'ADN quatre bases artificielles en place des naturelles, créant une structure stable double brin ressemblant à l'ADN naturel, sans en être !

Cette nouvelle structure chimique est une étape vers des développement de biologie synthétique "orthogonaux" aux systèmes génétiques naturels.

<http://english.peopledaily.com.cn/90001/90781/6444378.html>

Doi et al. Artificial DNA Made Exclusively of Nonnatural C-Nucleosides with Four Types of Nonnatural Bases. Journal of the American Chemical Society, 2008

August 31, 2008, at 12:10 PM by sb -
Added lines 4-14:

Quelques rapports sur la biologie synthétique

  • Royal Society - Synthetic biology scientific discussion meeting summary

lien vers le rapport

  • International Risk Governance Council - Synthetic Biology - Risks and opportunities of an emerging field

lien vers le rapport

July 19, 2008, at 07:26 PM by SB -
July 19, 2008, at 02:12 PM by SB -
Changed line 13 from:
to:

Les conférences sont accessibles en streaming video

July 03, 2008, at 10:27 AM by SB -
July 03, 2008, at 10:27 AM by SB -
Added lines 4-49:

Université de tous les Savoirs UTSL

Série de conférences en Juillet sur des thèmes de Biologie Synthétique

Nouveau cycle de conférences : Qu'est ce que la vie ? Où en est-on de la connaissance du génome ?

Vendredi 4 juillet à 18h30

  • Diversité du génome humain : de l’histoire des populations humaines aux maladies

infectieuses Par Luis Quintana Murci Directeur de l’unité de génétique évolution humaine, Institut Pasteur

Samedi 5 juillet à 18h30

  • L’homme transgénique : des possibilités infinies

Par Miroslav Radman, Généticien, Université Paris 5, faculté de médecine Necker et Jean-Claude Weill Immunologiste, Université Paris 5, faculté de médecine Necker

Dimanche 6 juillet à 18h30

  • Reproduction du génome : quel est son rôle dans le développement et la

différentiation ? Par Marcel Méchali Biologiste moléculaire, Directeur de recherches CNRS

Lundi 7 juillet à 18h30

  • Pourquoi et comment faire des formes de vie nouvelles ?

(de l’évolution Darwinienne à l’évolution Leibnizienne) Par Philippe Marlière Généticien, Isthmus France

Mardi 8 juillet à 18h30

  • Peut-on concevoir la cellule comme un ordinateur qui ferait des ordinateurs ?

Par Antoine Danchin Biologiste, Institut Pasteur

June 26, 2008, at 09:59 AM by SB -
Changed line 12 from:
to:

Références

June 26, 2008, at 08:59 AM by SB -
Added lines 4-13:

La Biologie synthétique discutée par le groupe de surveillance des technologies du parlement européen

The group discussing synthetic biology started by asking: “Why should TA be interested in synthetic biology?” Their answer was that synthetic biology is a concept with imaginative power, surrounded by uncertainty, and a typical example of emerging technologies where there is a need of information.

Future TA projects may assess what synthetic biology is, who is involved, what kind of dynamics, what actors think it may lead to, both with respect to intended and unintended consequences. Both national and international project designs were provided by this group

http://www.eptanetwork.org/EPTA/news.php?article=16?

June 26, 2008, at 08:52 AM by SB -
Changed lines 4-11 from:
to:

Conférence de Biologie Synthétique à Evry les 26 ey 27 Juin 2008

NewSynBio Epigenesis 26/27 June workshop on Design Strategies for Synthetic Biology that starts Today.

Un beau programme.

June 16, 2008, at 12:32 PM by SB -
Changed lines 12-14 from:

[[Rapport OCDE |Plus de détails]

to:
Added line 16:
Added line 18:
Added line 20:
June 16, 2008, at 12:31 PM by SB -
June 16, 2008, at 12:31 PM by SB -
Changed lines 5-6 from:

RSS: Syndiquer le blog !

to:
Changed lines 10-40 from:

Today, scientists are going beyond sequencing and manipulating genes, they are building life from scratch. Synthetic biology refers to the design and construction of new biological parts, devices and systems which do not exist in the natural world and to the redesign of existing biological systems to perform specific tasks. Basically, synthetic biology breaks down biological processes (e.g. protein production from a gene) to build systems that perform a particular desired function (e.g. oscillators which can produce protein on demand). Scientists predict that within 2-5 years it will be possible to synthesize any virus. In 5-10 years simple bacterial genomes will be routinely synthesized and the construction of designer genomes commonplace. These ―designer genomes‖ will be inserted into empty bacterial cells thus giving birth to new living and self- replicating organisms. Other synthetic biologists hope to reconfigure the genetic pathways of existing organisms to perform new functions such as the manufacture high-value drugs or chemicals. Synthetic biology is a powerful and transformative technique which merges biology and engineering. It opens up enormous scientific, commercial, and health opportunities. The promise of synthetic biology needs to be better understood, the variety of players involved identified, and their – potentially conflicting – research norms and business strategies explored.

Synthetic biology will undoubtedly also raise policy challenges for governments if the maximum benefits are to be realised. These include social, economic, and legal challenges, as well as biosecurity and safety concerns. Parallels to past experience with transformative technologies in the life sciences may be drawn (genetic engineering and bio-nano). The OECD is in an ideal position to forge a common understanding in the policy community of the issues to be aware of (research needs, community building, safety and security concerns, regulatory implications, market pathways, public understanding). Moreover, the OECD can launch an early dialogue on what reasonable and responsible conduct might entail in this field and thus assure that the economic and social benefits of this new technology are safely encouraged. An expert meeting will be held on 22-26 October 2008 in Bellagio, Italy. This meeting will discuss and plan a joint conference of the OECD,, US National Academy of Sciences and the UK Royal Society expected to take place in Washington DC. United States, late 2008.

Voir à la page 13

to:

Réflexions pour une stratégie de développement de la biologie synthétique. Prospection technologique et économique.

[[Rapport OCDE |Plus de détails]

Changed lines 16-17 from:
to:

RSS: Syndiquer le blog ! Le Rapport, voir page 13

June 16, 2008, at 12:12 PM by SB -
Changed line 7 from:

---

to:

Changed line 47 from:
to:
June 16, 2008, at 12:10 PM by SB -
Added lines 6-42:

---

La biologie Synthétique dans le rapport des bioltechnologies de l'OCDE

Today, scientists are going beyond sequencing and manipulating genes, they are building life from scratch. Synthetic biology refers to the design and construction of new biological parts, devices and systems which do not exist in the natural world and to the redesign of existing biological systems to perform specific tasks. Basically, synthetic biology breaks down biological processes (e.g. protein production from a gene) to build systems that perform a particular desired function (e.g. oscillators which can produce protein on demand). Scientists predict that within 2-5 years it will be possible to synthesize any virus. In 5-10 years simple bacterial genomes will be routinely synthesized and the construction of designer genomes commonplace. These ―designer genomes‖ will be inserted into empty bacterial cells thus giving birth to new living and self- replicating organisms. Other synthetic biologists hope to reconfigure the genetic pathways of existing organisms to perform new functions such as the manufacture high-value drugs or chemicals. Synthetic biology is a powerful and transformative technique which merges biology and engineering. It opens up enormous scientific, commercial, and health opportunities. The promise of synthetic biology needs to be better understood, the variety of players involved identified, and their – potentially conflicting – research norms and business strategies explored.

Synthetic biology will undoubtedly also raise policy challenges for governments if the maximum benefits are to be realised. These include social, economic, and legal challenges, as well as biosecurity and safety concerns. Parallels to past experience with transformative technologies in the life sciences may be drawn (genetic engineering and bio-nano). The OECD is in an ideal position to forge a common understanding in the policy community of the issues to be aware of (research needs, community building, safety and security concerns, regulatory implications, market pathways, public understanding). Moreover, the OECD can launch an early dialogue on what reasonable and responsible conduct might entail in this field and thus assure that the economic and social benefits of this new technology are safely encouraged. An expert meeting will be held on 22-26 October 2008 in Bellagio, Italy. This meeting will discuss and plan a joint conference of the OECD,, US National Academy of Sciences and the UK Royal Society expected to take place in Washington DC. United States, late 2008.

Voir à la page 13

OCDE Biotechnology Update Internal Co-ordination Group for Biotechnology (ICGB) No. 19, 30 April 2008

June 16, 2008, at 12:03 PM by SB -
Changed line 10 from:
to:
June 16, 2008, at 11:46 AM by SB -
Changed lines 9-10 from:
to:
Changed line 18 from:

to:
June 16, 2008, at 11:45 AM by SB -
June 16, 2008, at 11:41 AM by SB -
Added lines 6-19:

À quelle vitesse réagit une cellule stressée ? Où, comment caractériser les fonctions de réponses cellulaires.

Attach:Image_Pascal.jpg Δ

De nouveaux progrès ces dernières années combinant des techniques d'imagerie et de microfluidique permettent de suivre les comportements de cellules isolées suite à des changements des conditions environnementales parfaitement contrôlées. Ces techniques permettent d'étudier les comportements cellulaires et de caractériser avec précision les comportements de circuits de régulation. De telles mesures sont importantes pour connaître les dynamiques des éléments de circuits que l'on voudrait exploiter dans des applications de biologie synthétique.

Pascal Hersen, du laboratoire Matières et Systèmes Complexes, CNRS - Université Paris Denis Diderot a publié un article dans PNAS étudiants comment une cellule oumise à un stress, telle la modification de son environnement, éagit plus ou moins rapidement pour assurer sa survie. Chez la levure, cela passe par une succession de réactions connues, mais dont la dynamique n'avait jamais été étudiée. C'est désormais chose faite grâce au chercheur CNRS Pascal Hersen(1) et à ses collègues américains de l'Université de Harvard(2). Après avoir mis au point un dispositif de mesures simple et innovant, les scientifiques ont confirmé l'hypothèse selon laquelle au-delà d'une certaine fréquence de stimulation, la cellule de levure ne répond plus à un stress osmotique(3). Les chercheurs sont dorénavant capables de mesurer la vitesse de réaction pour ce stress, et surtout, de modifier celle-ci en supprimant certains gènes. Ces travaux ouvrent de nouvelles perspectives en ingénierie du vivant. L'idée est de construire des cellules aux fonctions biologiques novatrices et dont la dynamique est contrôlée. Ils sont publiés en ligne sur le site de la revue PNAS.

May 14, 2008, at 04:28 PM by SB -
Changed line 179 from:

Synthèse complète d'un génome bactérien

to:

Synthèse complète d'un génome bactérien

May 09, 2008, at 07:47 PM by SB -
Changed lines 21-23 from:

Interview de la commissaire Paola Antonelli présentant l'exposition, les relations entre design, art et science dans la société actuelle et le cas de loeuvre Victimless leather''.

to:

Interview de la commissaire Paola Antonelli présentant l'exposition, les relations entre design, art et science dans la société actuelle et le cas de l'oeuvre Victimless leather.

Le véritablement extraordinaire site web de l'exposition Design and the Elastic Mind.

May 09, 2008, at 07:45 PM by SB -
Added lines 6-21:

Victimless leather, R.I.P.

Biologie Synthétique ? Exploration "artistique" d'un paradigme.

Le Museum of Modern Arts de New York a organisé une exposition fascinante de design, art et science Design and the Elastic Mind qui expose des créations dans le même cadre conceptuel que les nanosciences et les biotechnologies. La biologie synthétique y est aussi présente.

En particulier l'oeuvre Victimless leather par les artistes australiens Oron Catts et Zurr est surprenante car "vivante", faite d'un tissu de cellules souches en croissance. Ou plutôt était vivante, car elle a du être exécutée par la commissaire de l'exposition comme la croissance était trop rapide ! Que penser ?

Sur l'"exécution" de l'oeuvre

Interview de la commissaire Paola Antonelli présentant l'exposition, les relations entre design, art et science dans la société actuelle et le cas de loeuvre Victimless leather''.

May 05, 2008, at 11:25 AM by SB -
Added lines 10-11:
May 05, 2008, at 11:23 AM by SB -
Added lines 6-12:

Conférence "électronique" sur les aspects sociaux de la biologie synthétique

Une initiative originale dans le cadre du programme européen Synbiosafe : la tenue d'une "conférence" sous forme de forum internet sur les questions éthiques, sécurité, société soulevées par la biologie synthétique.

Pour plus de détails

April 25, 2008, at 12:10 PM by SB -
April 25, 2008, at 12:10 PM by SB -
April 25, 2008, at 12:10 PM by SB -
Added lines 6-21:

Création d'un Pôle "Biologie Systémique et Synthétique" d'UniverSud Paris

Lancement au sein du PRES (Pôle de Recherche et Enseignement Supérieur) UniverSud qui regroupe plusieurs établissements universitaires au sud de Parsi (notamment Orsay) d'un "Pôle" sur le thème de la Biologie Systémique et Synthétique dans le but de faire se rencontrer et discuter tous les utilisateurs présents et futurs des ces concepts et de ces outils.

Un colloque de lancement est organisé les 5 et 6 mai 2008.

Lien vers la page du colloque.

April 25, 2008, at 11:38 AM by SB -
Changed lines 36-37 from:

http://www.ecltech.org/Inaug_LivingTech_Eng.pdf? Lien vers la page web du labor ECLT

to:

Plaquette de l'inauguration

Lien vers la page web du laboratoire ECLT

April 25, 2008, at 11:35 AM by SB -
Changed lines 36-38 from:

http://www.vegapark.ve.it/vega/acms/vega/ http://www.ecltech.org/Inaug_LivingTech_Eng.pdf

to:

http://www.ecltech.org/Inaug_LivingTech_Eng.pdf? Lien vers la page web du labor ECLT

April 25, 2008, at 11:32 AM by SB -
Added lines 6-39:

European Center for Living Technology

Inauguration d’un laboratoire de cellules artificielles à Venise

Source: http://www.actinbiotech.com/?p=1583

Le 10 mars 2008 a été inauguré le LivingTech Laboratory, un centre d'excellence dédié aux bionanotechnologies, au sein du parc Vega de Venise. Le centre est l'un des premiers laboratoires européens consacré à la biologie de synthèse et s'occupe de la construction de modèles expérimentaux de cellules artificielles simples. Le prototype de cellule constitué d'une membrane et d'ADN de synthèse élaboré par les chercheurs pourra être utilisé pour produire des principes actifs ou des médicaments dont l'action doit être dirigée vers des organes cibles. Ces cellules artificielles peuvent également être utilisées pour la synthèse de composés rares ou coûteux. Le but des chercheurs est d'arriver à comprendre à travers ces modèles simplifiés créés en laboratoire, comment fonctionnent des systèmes plus complexes. Le laboratoire a reçu un financement de la Fondation de Venise d'environ 1,5 million d'euros. Il travaille en collaboration avec de nombreuses Universités européennes, regroupées dans le consortium European Centre for Living Technology, dont le siège est à Venise. Le projet collectif a été dénommé Pace (Programmable Artificial Cell Evolution) et recevra un financement de l'Union Européenne de 8,5 millions d'euros.

http://www.vegapark.ve.it/vega/acms/vega/ http://www.ecltech.org/Inaug_LivingTech_Eng.pdf

April 21, 2008, at 02:26 PM by SB -
Changed line 12 from:

[Meeting Royal Society|Pour plus de détails]

to:
April 21, 2008, at 02:25 PM by SB -
Added lines 6-14:

Meeting de la Royal Society les 2 et 3 juin 2008

Rencontre organisée par la Royal Society à Londres pour discuter du futur de ce domaine au Royaume Uni.

[Meeting Royal Society|Pour plus de détails]

April 17, 2008, at 03:22 PM by SB -
Changed lines 10-12 from:

Une conférence qui s'annonce très intéressante avec un spèctre large sur les nanotechnologies, biotechnologies et biologie-synthétique. Illustration caractéristique de la convergence de discplines différentes pour une nouvelle Science et de nouvelles applications "nano".

to:

Une conférence qui s'annonce très intéressante avec un spèctre large sur les nanotechnologies, biotechnologies et biologie-synthétique. Illustration caractéristique de la convergence de discplines différentes pour une nouvelle Science et de nouvelles applications "nano". Texte de présentation de la conférence très intéressant.

April 17, 2008, at 03:20 PM by SB -
Added lines 6-50:

Conférence à Saint Petersbourg

Une conférence qui s'annonce très intéressante avec un spèctre large sur les nanotechnologies, biotechnologies et biologie-synthétique. Illustration caractéristique de la convergence de discplines différentes pour une nouvelle Science et de nouvelles applications "nano".

The Second Saint-Petersburg International Conference on NanoBiotechnologies June, 16-18 2008, Saint-Petersburg Russia

The NANOBIO'08 is intended to give a comprehensive picture of the latest R&D breakthroughs in Nanobiotechnology, to discuss open problems and define future trends in this exciting field. Biological systems are inherently nano in scale. Nanobiotechnology is at the interface of physical and biological sciences. It is a new R&D direction, with the potential of revolutionizing medicine: it combines the tools, ideas and materials of nanoscience and biology; it addresses biological problems that can be studied and solved by nanotechnology; it thinks out ways to construct molecular devices using biomacromolecules; and it attempts to build molecular machines utilizing concepts seen in nature. Biology is increasingly asking quantitative questions. Quantification is essential if we are to understand how the cell works, and details of its regulation. The physical sciences provide tools and strategies to obtain accurate measurements and simulate the information to allow to comprehend the processes. The development of computational modeling and informatics software will enable scientists and engineers to apply nanotechnology to key areas of medical research, including diagnostics, biosensing, drug delivery and biomaterial design. The aim of this event is to set the discussion between biologists, physicists, computer scientists and engineers, traditionally divided groups, and bridge the gap between materials science and life science.

This event will bring together leading scientists, representatives of industry, public research and governmental bodies and will provide the international forum for exchange of information and expertise in the area of Nanobiotechnology. The organizers hope that the event will be an ideal platform for experts from around the world to interact, network and exchange ideas. During NanoBio'08 conference a special session will be devoted to the responsible approach of development of Nanobiotechnology. The main objective of the special session is to discuss joining of Russia to the bodies responsible for international cooperation on environmental, health and safety impacts of nanobiotechnology; to present and to launch Russian Technology Platform "Nanobiotechnology. The session will provide new possibilities for strengthening and enhancing international cooperation between European and Russian scientists in the area of Nanobiotechnology, in particular in the fields affiliated to the Thematic Priority 4 of FP7 - NMP. The scientific program NanoBio'08 will consist of oral, poster and position presentations. The first conference (Nanobio'06) was held on November 27 -29, 2006 at the Saint-Petersburg Physico-Technical Center for Research and Education of RAS. It was focused on biological aspects of nanobiotechnology.

Topics

  • Artificial Nanostructures
  • Self-organized Nanostructures
  • Nanoscale organization of biological systems
  • Nanocarbon
  • Energy Nanomaterials
  • System Biology
  • Synthetic Biology
  • Nanobionics
  • Molecular Design
  • Synthetic Biology
  • Integrative Data and Text Mining Approaches
  • Nanomechanics and Nanohydrodynamics
  • Diagnostics and nanobiosensors
  • Bio and Medical Applications
  • Nanobiotech Risks Assessment for Human Health and Environment
  • Nanobiotech Education and Industrial Innovation
  • Far Future Challenges

Competitions Russian Young Scientists Competition (UMNIK). See www.fasie.ru. Official Language English will be the official language of the conference

April 07, 2008, at 11:32 PM by SB -
Changed line 5 from:

RSS: Syndiquer le blog !

to:

RSS: Syndiquer le blog !

March 27, 2008, at 10:32 AM by SB -
Added lines 6-13:

Fabrication d'enzyme artificielle

Des scientifiques de l'université de Washington et du Weizman Institute ont fabriqué une enzyme artificielle en partant d'un design in silico suivi par une phase d'optimisation de l'activité par de l'évolution moléculaire in vitro !

Lien vers une news détaillée en anglais (publié d'ailleurs sur un excellent blog de Science)

Lien vers l'article, pour qui a accès à Nature... Sergio G Peisajovich, Dan S Tawfik, ' Protein engineers turned evolutionists', Nature Methods 4, 991 - 994 (01 Dec 2007)doi: 10.1038/nmeth1207-991.

March 26, 2008, at 04:03 PM by SB -
Added lines 12-17:

Objectifs de la conférence, rassembler des chercherus qui travaillent sur:

  • conception et construction de composants biologiques, dispositifs et systèmes biologiques intégrés.
  • développement de technologies pour permettre ce travail
  • placer cette recherche scientifique et technologique dans le contexte social actuel et futur.
March 26, 2008, at 03:58 PM by SB -
Changed lines 11-13 from:

La conférence se tiendra à Hong-Kong du 10 au 12 octobre 2008. En parallèle des sessions traditionnelles un fonctionnement "communautaire" est prévu sur le modèle des sciFoo camp avec des activités initiées et animées par les participants eux-mêmes. A suivre...

to:

La conférence se tiendra à Hong-Kong du 10 au 12 octobre 2008. En parallèle des sessions traditionnelles un fonctionnement "communautaire" est prévu sur le modèle des sciFoo camp avec des activités initiées et animées par les participants eux-mêmes. A suivre...

La conférence est organisée par la BioBricks foundation de Drew Endy.

March 26, 2008, at 03:55 PM by SB -
Added lines 6-11:

Ouverture du site web de la conférence Synthetic Biology 4.0

La conférence se tiendra à Hong-Kong du 10 au 12 octobre 2008. En parallèle des sessions traditionnelles un fonctionnement "communautaire" est prévu sur le modèle des sciFoo camp avec des activités initiées et animées par les participants eux-mêmes. A suivre...

March 20, 2008, at 04:35 PM by SB -
Deleted lines 6-14:

---

Workshop Biologie Synthétique à l'Institut Pasteur

Le 12 mars 2008 s'est tenu la première journée scientifique française de biologie synthétique avec des présentations par plusieurs chercheurs français actifs dans le domaine et des invités étrangers.

Plus de détails sur la journée ici.

Added lines 8-22:

Interview de Craig Venter

(:youtube A-mCWIGVgmQ:)


Workshop Biologie Synthétique à l'Institut Pasteur

Le 12 mars 2008 s'est tenu la première journée scientifique française de biologie synthétique avec des présentations par plusieurs chercheurs français actifs dans le domaine et des invités étrangers.

Plus de détails sur la journée ici.


March 20, 2008, at 04:00 PM by SB -
Changed lines 8-12 from:

Une interview de Craig Venter à la BBC

(:youtube mCWIGVgmQ:)


to:
March 20, 2008, at 03:57 PM by SB -
Added lines 7-11:

---

Une interview de Craig Venter à la BBC

(:youtube mCWIGVgmQ:)

March 19, 2008, at 11:56 AM by SB -
Added line 6:
Added lines 8-15:

Workshop Biologie Synthétique à l'Institut Pasteur

Le 12 mars 2008 s'est tenu la première journée scientifique française de biologie synthétique avec des présentations par plusieurs chercheurs français actifs dans le domaine et des invités étrangers.

Plus de détails sur la journée ici.


January 28, 2008, at 10:55 AM by SB -
Added lines 7-17:

Synthèse complète d'un génome bactérien

Une étappe supplémentaire a été franchie dans le programme de Craig Venter de fabrication d'une usine cellulaire. Après avoir annoncé en juin dernier la capacité de cloner un chromosome bactérien entier dans une bactérien hote. Il vient d'annoncer la capacité de synthétiser entièremennt, à partir de séquences d'ADN contenues dans une base de données, la molécule d'ADN génante formant le chromosome de la bactérie Mycoplasma genitalium. La prochaine étape de son programme sera d'insérer ce chromosome artificiel dans une cellule hote grâce à la technique publié l'été dernier. On pourra alors booter ce nouvel organisme obtenu à la manière dont on démarre un ordinateur avec un nouveau système d'exploitation...

Gageons dans 6 mois une nouvelle campagne de presse triomphante.

Lien vers un article du Monde sur ce travail

Lien vers un compte rendu de la présentation du programme de travail de l'équipe de C. Venter par Hamilton Smith (prix Nobel)


December 14, 2007, at 12:39 AM by SB -
Added lines 7-15:

Club scientifique de biologie systémique et synthétique

Le club de Biologie Systémique et Synthétique est composé d'un groupe d’étudiants de diverses grandes écoles et universités parisiennes (ParisTech, Paris 5, Paris 7, Paris 11, ENS...) de nombreuses disciplines (biologie, médecine, physique, chimie, informatique...). Son objectif est de se réunir régulièrement pour discuter et étudier en intéraction avec des chercheurs les développements récents dans ces domaines scientifiques émergents. Le club cherche également à animer la communauté de biologie synthétique parisienne, et a préparer une équipe parisienne à la compétition internationale iGEM. L'année dernière ces réunions ont conduit à la première participation française, qui a connu le succès du billet précédent !

La première session du club aura lieu Vendredi 14 décembre à 18 h au CRI (Centre de Réflexions Interdisciplinaires) Faculté de Médecine Université René Descartes-Paris V Site Cochin Port-Royal 24, rue du Faubourg St Jacques 75014 PARIS 2ème étage salles 2017-2018

Plus d'informations sur le wiki du club :


December 14, 2007, at 12:34 AM by SB -
Changed lines 47-48 from:
to:
Changed lines 119-120 from:
to:
Changed lines 136-137 from:
to:
Changed lines 154-155 from:
to:
Changed lines 164-165 from:
to:
Changed lines 189-190 from:
to:
Changed lines 227-228 from:
to:
December 14, 2007, at 12:32 AM by SB -
Changed lines 13-14 from:
to:
December 14, 2007, at 12:31 AM by SB -
Added lines 1-234:

(:title Blog d'actualités:)

Cette rubrique vise à faire un suivi de l'actualité sur la biologie synthétique.

RSS: Syndiquer le blog !


La France à l'honneur

Article dans le Nouvel Observateur sur l'équipe parisienne

NOUVELOBS.COM | 30.11.2007 | 09:49

Attach:equipe_igem07.jpg Δ

Les membres de l'équipe (de gauche à droite, de haut en bas):Aurélien Rizk, David Puyraimond, David Bikard, Thomas Landrain, Eimad Shotar, Antoine Spicher, Gilles Vieira, Nicolas Chiaruttini, David Guegan.

Les membres de l'équipe (de gauche à droite, de haut en bas):Aurélien Rizk, David Puyraimond, David Bikard, Thomas Landrain, Eimad Shotar, Antoine Spicher, Gilles Vieira, Nicolas Chiaruttini, David Guegan. (DR) De jeunes étudiants parisiens des universités d'Evry, Orsay, de Paris-5, Paris-6, Paris-7, de l'Ecole Centrale de Paris, de l'Ecole Normale Supérieure et du Génopôle universités ont reçu le premier prix dans la catégorie "recherche fondamentale" au quatrième concours IGEM -International Genetically Engineered Machinery- organisé au MIT. Derrière ce nom anglais se cache une discipline émergente en science du Vivant : la biologie synthétique. Celle-ci vise à appliquer les méthodes de l'ingénierie à la biologie pour reprogrammer des organismes, par exemple, ou en créer de nouveaux, et leur faire exécuter des fonctions souvent inhabituelles (cf le dossier du n°709 de Sciences et Avenir, mars 2006). Des cultures cellulaires peuvent alors clignoter, changer de couleur, battre la mesure, exprimer des protéines d'intérêt thérapeutique...

Lien vers l'article complet

Lien vers le site web français de l'équipe

Lien vers le site web officiel de la compétition de l'équipe (en anglais).


Nouveau procédé d'amplification d'ADN sans enzymes pour la programmation de circuits biochimiques.

Article de recherche par David Yu Zhang, Andrew J. Turberfield, Bernard Yurke, Erik Winfree, California Institute of Technology.

Une nouvelle approche pour le design de circuits biochimiques à base d'ADN. Le système repose sur une amplification de séquences d'ADN sans l'intervention d'enzymes : des oligonucléotides (petites séquences d'ADN) entrée sont capables de catalyser la production d'autres oligonucléotides en sortie, pouvant elles-mêmes catalyser d'autres réactions. Dans chaque réaction un ADn catalysateur se lie à un brin complémentaire d'ADN et déplace les deux autres brins. Comme cette action augmente le désordre général (augmentation de l'entropie), la réaction est thermodynamiquement favorable et ne nécessite aucune enzyme pour avoir lieu.Plusieurs circuits ont été implémenté qui mettent en oeuvre cette méthode.

L'intérêt de cette invention est qu'il s'agit d'un système biomoléculaire basé sur l'ADN mais entièrement artificiel et a priori fortement programmable (n'importe quelle séquence peut-être amplifiée de la sorte). Ce système pourrait être une alternative sans enzymes à la PCR (Polymerase Chain réaction) qui a révolutionné la biologie moléculaire permettant déjà l'amplificiation de toute séquence d'ADN !

Publié dans Science du 16 November 2007 (Vol. 318. no. 5853, pp. 1121 - 1125)

Lien vers un article de vulgarisation sur le système, dans The Scientist (anglais).

Lien vers l'article de recherche dans la revue Science (accès payant à l'article)


Article d'orientation “Systems Biology in the European Research Area”.

Publié par le réseau européen ERASysBio pour la convergence des sciences de la vie avec les technologies de l'information et la science des systèmes.

Attach:PaperBioSystem.jpg Δ

La biologie systémique est un domaine en développement depuis une décennie, issue des grands programmes de génomique et des avançées de la biologie à grande échelle. L'accumulation d'énormes quantités de données de biologie moléculaire, rendue possible par l'application en biologie de techniques venant de la micro-électronique, la robotique et l'informatique a ouvert des perspectives totalement inédites du vivant. La biologie systémique vise à donner un sens à l'ensemble des informations génétiques et moléculaires recueillies pour comprendre comment toutes les parties d'un organisme vivant qui sont reliées les unes avec les autres dans des réseaux complexes d'interactions aboutissent aux comportements coordonnés, sophistiqués du vivant.

Cet article retrace comment la biologie systémique est intrinsèquement interdisciplinaire, et la présence des mathématiques et des statistiques pour intégrer les données biologiques dans des modèles prédictifs des comportements biologiques.

Et la biologie syntétique ?

La biologie systémique cherche à comprendre l'organisation et la dynamique des systèmes biologiques. On peut concevoir la biologie synthétique comme la mise en application des connnaissances et méthodes de la biologie systémique pour construire de nouveaux systèmes, en s'inspirant du motto de Richard Feynmann "Je ne comprends vraiment que ce que je suis capable de recréer.

Lien vers l'article (texte en anglais)


Grand succès de l'équipe française à iGEM

Pour sa première participation l'équipe francilienne a gagné une médaille d'or pour ses contributions au registry des Biobricks, le premier prix de iGEM dans la section technologies fondamentales, et a été qualifiée dans la finale du grand prix !

L'équipe gagnante du grand prix a été celle Pekin.


Première équipe française au concours international iGEM de Biologie Synthétique au MIT

Le rassemblement final du concours étudiant de biologie synthétique iGEM aura lieu du 3 au 4 novembre 2007 au MIT, avec pour la première fois la participation d'une équipe française.

L'international Gene Engineered Machines competition (iGEM) organisée par le MIT (Massachusetts Institut of Technology) réunit depuis 2004 des équipes d'étudiants venant d'universités du monde entier pour inventer des systèmes biologiques synthétiques (http://parts.mit.edu/igem07/index.php/Main_Page). Ce premier week-end de novembre les équipes de tous les pays se réunissent au MIT pour le Jamboree iGEM et confronter leurs projets préparés durant l'été. La compétition iGEM a donné lieu ces dernières années a des publications dans les plus grandes revues scientifiques mondiales (Nature, Science...).

L'édition 2007 du Jamboree sera la plus grande à ce jour. 57 équipes y présenteront devant un jury prestigieux des projets très variés dont le point commun est la reprogrammation d’organismes vivants: des bactéries comme substitut sanguin, un organisme multicellulaire à partir de bactéries, des levures pour mesurer la qualité de l'huile d'olive, comment donner de la mémoire à des bactéries, des détecteurs bactériens pour la contamination en cuivre et mercure, un dispositif pour détecter les infections urinaire, une nouvelle approche contre le virus du sida, des piles à bactéries, ainsi que beaucoup d'autres inventions.

Portée par les étudiants eux-mêmes, cette année voit la première participation d'une équipe française constituée de 11 étudiants de niveaux L3 à M2 de différents établissements universitaires d'Ile de France et venant de cursus en physique, informatique, médecine et biologie, conformément à la démarche interdisciplinaire de la biologie synthétique. Le projet français a consisté dans la préparation du premier organisme synthétique multicellulaire bactérien, un nouvel outil pour l'ingénierie de systèmes biologiques complexes (http://parts.mit.edu/igem07/index.php/Paris) et la compréhension du mutualisme biologique. Dans ce but l'équipe a combiné à la fois des approches théoriques et expérimentales. Les étudiants français se sont retrouvés pour leur projet depuis le mois de mai et durant tout l'été au Centre de Recherches Interdisciplinaire (Université Paris Descartes) en dehors de leurs cursus universitaire et sans soutien direct de leurs établissements (à la différence de ce qui se pratique habituellement dans d'autres pays participants). Cette participation démontre le formidable potentiel attractif de iGEM pour l'apprentissage des sciences et technologies, de la recherche et du travail collectif. La participation de l'équipe française a été possible grâce au soutien financier généreux de la Fondation Bettencourt-Schueller, de Soffinova Partners, de l'ambassade de France à Washington, et du projet européen Synbiocomm.

Parvenir à la compétition finale à l'MIT a déjà été une réussite significative. Les gagnants de iGEM 2007 seront annoncés Dimanche 4 Novembre et donneront lieu à un communiqué ultérieur.


Une Synthèse de la conférence Synthetic Biology 3.0

Pratiquement toutes les présentations de cette conférences sont accessibles en ligne. Pas mal, mais il faut avoir la patience de toutes les écouter, sauf si on sait laquelle écouter tout particulièrement. Voir ici pour une synthèse, subjective, des interventions les plus marquantes. De quoi aider à faire un choix.


I am creating artificial life, declares US gene pioneer

Par Ed Pilkington in New York, The Guardian, Saturday October 6 2007

Dans cet article on trouve Craig Venter déclare que très prochainement il annoncera la construction d'un chromosome synthétique entier à partir de produits chimiques et des informations génétiques dans les bases de données d'ADN. Ce développement est bien sûr présenté avec renforts de publicités comme permettant de résoudre tous les problèmes énergétiques et le réchauffement du climat...

''Craig Venter, the controversial DNA researcher involved in the race to decipher the human genetic code, has built a synthetic chromosome out of laboratory chemicals and is poised to announce the creation of the first new artificial life form on Earth.

The announcement, which is expected within weeks and could come as early as Monday at the annual meeting of his scientific institute in San Diego, California, will herald a giant leap forward in the development of designer genomes. It is certain to provoke heated debate about the ethics of creating new species and could unlock the door to new energy sources and techniques to combat global warming.''

  • La suite de l'article dans The Guardian
  • La Répubblica (quotidien italien) a repris la nouvelle. Avec commentaire de l'Eglise catholique à la clé (qui minimise la portée éthique de l'expérience).
  • Un commentaire avec des précisions du porte parole de Craig Venter sur le site iTWire

Appel d'un groupe de scientifiques pour le développement de la biologie synthétique

Attach:Kavli.jpg Δ

Un groupe de 17 scientifiques réunis par la http://kavlifoundation.org/fondation Kavli de soutien aux nanosciences en juin 2007 a publié un appel très en faveur de la biologie synthétique. L'initiative d'un tel texte et son contenu démontre surtout le fort intérêt des milieux de la nanotechnologie pour les développements dans le champ biologique. C'est une illustration de la notion de technologie convergente pour la biologie synthétique, qui l'est encore plus que les nanotechnologies au sens strict. Le symposium après lequel cette déclaration a été publiée s'intitulait: 'The merging of bio and nano: towards cyborg cells'.

  • texte de l'appel publié
  • Communiqué de presse de la fondation Kavli

Forecasting a Revolution in Science, the Ilulissat Statement Concludes an International Meeting of Renowned Researchers at the Inaugural Kavli Futures Symposium


Création d'une mémoire cellulaire dans un eukaryote

Attach:PSilver.jpg Δ

Rational design of memory in eukaryotic cells, Caroline M. Ajo-Franklin et al. GENES & DEVELOPMENT 21:2271-2276, 2007

Ce nouvel article de recherche du groupe de Pamela Silver à l'MIT fait la démonstration comment une mémoire cellulaire peut-être implémentée dans une cellule eukaryote. Le principe n'a rien de particulier, le sysème repose sur le comportement bien connu d'une boucle de régulation positive qui peut posséder deux états stable, actif ou inactif. La nouveauté réside dans la réalisation qui a été faite de ce type de circuit. Le dispositif présenté est facilement inductible, robuste et fidèle (l'état d'activation est hérité de façon stable sur de nombreuses générations de cellules).

Une telle mémoire pourrait-être utilisée dans des applications de recherche pour identifier des cellules soumises à des conditions particulière et déterminer si ces conditions sont corrélées à des comportements ultérieurs. Le module mémoire pourait-aussi être intégré dans des circuits plus grands qui amèneraitent la cellule à se différencier d'une certaine façon après des événements particuliiers.

Présentation de l'article sur TheScientist.com(anglais)

Lien vers l'article de recherche


Videos et proceedings de la conférence Synthetic Biology 3.0

Attach:conf_SB3.jpg Δ

Cette édition de la première et principale série de conférences sur la biologie synthétiquue a eu lieu pour la première fois à Zürich en juin dernier. Elle a manifesté la montée en puissance de cette discipline en réunissant plus de trois cent chercheurs du monde entier. Devant l'affluence des demandes les organisateurs on du sélectionner les participants en privilégiant ceux qui présentaient au moins un poster.

Comme pour les précédentes éditions, des reprises vidéos des présentations sont en ligne, ainsi que les proceedings, sur le site de la conférence.


Advances in Synthetic Biology

Attach:Banniere_conf.gif Δ

Une nouvelle conférence annoncée sur la biologie synthétique

Welcome to the inaugural Advances in Synthetic Biology conference and exhibition. Synthetic biology is the design and construction of new biological parts, devices and systems, and the re-design of existing, natural biological systems for useful purposes. Its interdisciplinary nature between science and engineering, as well as the many potential applications in the health, material and energy sectors, make this a particularly exciting conference.

Agenda Topics:

  • Design & Fabrication of Parts, Devices and Systems
  • The Chemistry of Synthetic Biology
  • Protein, Metabolic & Therapeutic Engineering
  • Cell & Tissue Engineering
  • Regulatory, IP, Ethical & Business Issues

Semble être une initiative privée de la société de conseil et communication Select Biosciences. Pas d'informations scientifiques disponibles.


Un nouvel interrupteur génétique

A Tunable Genetic Switch Based on RNAi and Repressor Proteins for Regulating Gene Expression in Mammalian Cells, par Tara L. Deans, Charles R. Cantor, and James J. Collins

Publication dans la revue Cell du 27 juillet 2007

Attach:Interrupteur_Colling.jpg Δ

Les auteurs ont mis en oeuvre une approche de biologie synthétique pour créer un des composants d'un circuit génétique permettant d'allumer ou d'éteindre efficacement l'expression de certains gènes mis sous son contrôle. L'originalité est d'avoir combiné plusieurs systèmes de contrôle ensemble: l'interférence d'ARN, des protéines de répression et des réactions biochimiques avec des petites molécules. Ce système fonctionne dans des cellules mamifères.

Liens

  • Article de vulgarisation (en anglais)
  • Article de recherche dans la revue Cell

Le groupe de James J. Collins de l'Université de Boston a très tôt été impliqué dans le courant actuel de biologie synthétique. Physicien de formation, J.J. Collins s'est d'abord intéressé à la modélisation de la dynamique de réseaux génétiques en appliquant des approches issues de la théorie systèmes dynamiques, avec en particulier la prise en compte du bruit dans des circuits. Ce groupe a rédigé des revues scientifiques de haut niveau très claires à propos de la modélisation de réseaux génétiques en vue d'applications à la bilogie synthétique.

Liens

  • Site web de James J. Collins

Une bactérie change d'espèce par transplantation de génome

Une annonce de presse de AP(Washington) du 29 juin 2006 suite à l'annonce à la conférence Synthetic Biology 3,0 à Zürich par par le prix Nobel Hamilton Smith, qui travaille avec Craig Venter, de la substitution du chromosome d'une bactérie par un autre d'une autre espèce. (Cette annonce a été reprise telle quelle par de nombreux média français, Le Monde, Le Nouvel Observateur, et des sites web d'actualités technologiques, l'équipe de Craig Venter fait bien sa promotion...)

Une étape importante vient d'être franchie dans le domaine des manipulations génétiques: des scientifiques américains dont les travaux sont publiés dans la revue américaine "Science" annoncent avoir réussi à transformer une espèce de bactérie en une autre par "transplantation de génome" complet.t d'autres spécialistes. Ni si cela signifie forcément qu'un chromosome artificiel puisse à lui seul activer une cellule vivante...

Lien vers la suite de l'article?


Construction d'un virus détruisant les biofilms bactériens

Attach:antiBiofilm.jpg Δ

Une application concrête de Bio Synthétique: la construction d'un phage synthétique (un virus qui n'attaque que des bactéries) qui détruit les dépôts de protéines secrétés par des colonies de bactéries. Ces couches de dépôt, appelées biofilms, isolent les bactéries de tratiements avec des antibiotiques? L'existence de ces films représente un problème de santé public car ils empêchent la bonne stérilisation du matériel médical. Le phage développé par l'équipe de JJ Collins au MIT à Boston a réussi à éliminer plus de 99,99% des bactéries d'un biofilm, soit deux ordres de grandeurs de mieux qu'un phage naturel.

Liens

  • Une présentation de vulgarisation en anglais
  • L'article de recherche original dans la revue PNAS


Page last modified on October 26, 2008, at 09:17 PM